Publications
論文
国際誌(査読あり)
- (2026) Haplotype bias detection using pedigree-based transmission simulation: traces of selection that occurred in apple breeding Horticulture Research 13(3), uhaf349. https://doi.org/10.1093/hr/uhaf349
- (2025) Population interaction in the Jōmon society via 3D data of human crania: geometric morphometric study JMIRx Bio 3, e72432-e72432. https://doi.org/10.2196/72432
- (2025) The cultural transmission of Ongagawa style pottery in the prehistoric Japan: quantitative analysis on three-dimensional data of archaeological pottery in the early Yayoi period Journal of the Royal Society, Interface 22(223), 20240889. https://doi.org/10.1098/rsif.2024.0889
- (2025) Wnt activation causes shell malformation in lymnaeoidean gastropods Journal of Molluscan Studies 91(1), eyaf001. https://doi.org/10.1093/mollus/eyaf001
- (2024) Three-dimensional leaf edge reconstruction combining two- and three-dimensional approaches Plant Phenomics 6, 0181. https://doi.org/10.34133/plantphenomics.0181
- (2024) Macro-scale population patterns in the Kofun period of the Japanese archipelago: quantitative analysis of a larger sample of three-dimensional data from ancient human crania Humans 4(2), 131–147. https://doi.org/10.3390/humans4020008
- (2024) Possible roles of Wnt in the shell growth of the pond snail Lymnaea stagnalis Scientific Reports 14(1), 26488. https://doi.org/10.1038/s41598-024-74794-7
- (2023) Theoretical morphological analysis of differential morphospace occupation patterns for terrestrial and aquatic gastropods Evolution 77(8), 1864–1873. https://doi.org/10.1093/evolut/qpad110
- (2023) Network feature-based phenotyping of leaf venation robustly reconstructs the latent space PLOS Computational Biology 19(7), e1010581. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010581
- (2023) Demic diffusion of the Yayoi people in the Japanese archipelago Letters on Evolutionary Behavioral Science 14(2), 1–7. https://doi.org/10.5178/lebs.2023.111
- (2023) Smoking enhances the expression of angiotensin-converting enzyme 2 involved in the efficiency of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection Microbiology and Immunology 67(1), 22–31. https://doi.org/10.1111/1348-0421.13034
- (2022) A proposal of a new automated method for SfM/MVS 3D reconstruction through comparisons of 3D data by SfM/MVS and handheld laser scanners PLOS One 17(7), e0270660. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0270660
- (2022) Model-based plant phenomics on morphological traits using morphometric descriptors Breeding Science 72(1), 19–30. https://doi.org/10.1270/jsbbs.21078 総説
- (2022) Exploring the mechanical and morphological rationality of tree branch structure based on 3D point cloud analysis and the finite element method Scientific Reports 12(1), 4054. https://doi.org/10.1038/s41598-022-08030-5
- (2021) GIS-based analysis for UAV-supported field experiments reveals soybean traits associated with rotational benefit Frontiers in Plant Science 12, 637694. https://doi.org/10.3389/fpls.2021.637694
- (2021) Detection of significant antiviral drug effects on COVID-19 with reasonable sample sizes in randomized controlled trials: a modeling study PLoS Medicine 18(7), e1003660. https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1003660
- (2021) Tracing founder haplotypes of Japanese apple varieties: application in genomic prediction and genome-wide association study Horticulture Research 8(1), 49. https://doi.org/10.1038/s41438-021-00485-3
- (2021) Phylogeography and shell morphology of the pelagic snail Limacina helicina in the Okhotsk Sea and western North Pacific Marine Biodiversity 51(2), 22. https://doi.org/10.1007/s12526-021-01166-z
- (2021) Climate-smart crops: key root anatomical traits that confer flooding tolerance Breeding Science 71(1), 51–61. https://doi.org/10.1270/jsbbs.20119 総説
- (2020) Field-based individual plant phenotyping of herbaceous species by unmanned aerial vehicle Ecology and Evolution 10(21), 12318–12326. https://doi.org/10.1002/ece3.6861
- (2020) A theoretical morphological model for quantitative description of the three-dimensional floral morphology in water lily (Nymphaea) PLOS One 15(10), e0239781. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0239781
- (2019) Genotype-aggregated planting improves yield in Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus) due to self/non-self-discrimination Evolutionary Applications 12(3), 508–518. https://doi.org/10.1111/eva.12735
- (2019) What is cost-efficient phenotyping? Optimizing costs for different scenarios Plant Science 282, 14–22. https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2018.06.015
- (2019) Comparison of shape quantification methods for genomic prediction, and genome-wide association study of sorghum seed morphology PLOS One 14(11), e0224695. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0224695
- (2018) Aerial imagery analysis – quantifying appearance and number of sorghum heads for applications in breeding and agronomy Frontiers in Plant Science 9, 1544. https://doi.org/10.3389/fpls.2018.01544
- (2018) Characterization of peach tree crown by using high-resolution images from an unmanned aerial vehicle Horticulture Research 5(1), 74. https://doi.org/10.1038/s41438-018-0097-z
- (2018) Phylogeography of the pelagic snail Limacina helicina (Gastropoda: Thecosomata) in the subarctic western North Pacific Journal of Molluscan Studies 84(1), 30–37. https://doi.org/10.1093/mollus/eyx040
- (2017) A heart–brain–kidney network controls adaptation to cardiac stress through tissue macrophage activation Nature Medicine 23(5), 611–622. https://doi.org/10.1038/nm.4326
- (2016) Geometric analysis and estimation of the growth rate gradient on gastropod shells Journal of Theoretical Biology 389, 11–19. https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2015.10.011
- (2014) Quantification and geometric analysis of coiling patterns in gastropod shells based on 3D and 2D image data Journal of Theoretical Biology 363, 93–104. https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2014.08.010
- (2012) Functional constraints on coiling geometry and aperture inclination in gastropods Paleobiology 38(2), 322–334. https://doi.org/10.1666/10060.1
その他
- (2026) データ解析の「落とし穴」~あなたのその解析,大丈夫ですか?~ 育種学研究 28(1), 81–86. https://doi.org/10.1270/jsbbr.28.W04
- (2025) 弥生時代前期土器の拡散過程を三次元の「かたち」から考える 科学 95(8), 683–687. https://cir.nii.ac.jp/crid/1520023627019934848
- (2025) 一生退屈しない「かたち」を測るための放浪 日本数理生物学会ニュースレター(105), 10–15.
- (2023) “かたち”のフェノーム数理解析への汎用形態記述子によるアプローチ 生体の科学 74(2), 123–128. https://doi.org/10.11477/mf.2425201656
- (2022) 遠賀川式土器を例とした三次元モデルと二次元実測図データの比較 情報考古学 27(1・2), 1–10. https://cir.nii.ac.jp/crid/1520010842636081152
- (2022) 遠賀川式土器の形態に関する数理的考察 -田村 遺跡、矢野遺跡、綾羅木郷遺跡を中心に- 奈文研論叢 3, 65–82. https://cir.nii.ac.jp/crid/1010025255267924227
- (2020) 植物科学の「人工知能」との関わり方を考える 植物科学の最前線 11(C), 185–206. https://doi.org/10.24480/bsj-review.11c2.00191
- (2019) 深層学習の利活用による植物表現型解析技術の展望 植物科学の最前線 10(B), 99–107. https://doi.org/10.24480/bsj-review.10b7.00160
- (2019) VDT作業者の安全衛生評価におけるDeep learningの活用 産業衛生学雑誌 61(6), 256–260. https://doi.org/10.1539/sangyoeisei.2018-040-C
- (2018) 産業保健におけるDeep learningの活用:物流企業の職場巡視画像を用いたパイロット研究 産業衛生学雑誌 60(6), 191–195. https://doi.org/10.1539/sangyoeisei.2018-022-C
- (2018) 野外における作物の3次元形態の再構築 アグリバイオ 2(3), 14–19. https://cir.nii.ac.jp/crid/1522543656033929216
- (2017) 巻きの理論形態モデル:有殻軟体動物を例に 日本数理生物学会ニュースレター(83), 19–23.
- (2016) フィラデルフィア滞在記 日本数理生物学会ニュースレター(78), 4–6.
- (2016) 育種学と農学のこれからを考える30 ~フェノタイピングは頭痛の種?~ 育種学研究 18(2), 67–71. https://doi.org/10.1270/jsbbr.18.67
- (2012) 腹足類殻形態への理論形態学的アプローチ 日本数理生物学会ニュースレター(67), 18–19.
- (2010) 巻貝殻形態の理論形態学的解析パッケージSpiral shell form 静岡大学地球科学研究報告 37, 57–73. https://doi.org/10.51053/shizuoka.37.0_57
著書(分担執筆)
- (2025) フェノタイピング 理論生物学事典, 46–47. 朝倉書店. ISBN: 978-4-254-17203-4.
- (2025) 貝の形 理論生物学事典, 219–221. 朝倉書店. ISBN: 978-4-254-17203-4.
- (2024) 三次元データを用いて研究する:具体例 カタチの由来、データの未来:三次元計測の人類史学, 89–123. 勁草書房. ISBN: 978-4-326-24854-4.
- (2024) 三次元データによる研究:方法 カタチの由来、データの未来:三次元計測の人類史学, 71–88. 勁草書房. ISBN: 978-4-326-24854-4.
- (2023) 植物3次元形態のデータ化,定量化,モデル化 植物の超階層生物学:ゲノミクス×フェノミクス×生態学でひもとく多様性, 285–307. 文一総合出版. ISBN: 978-4-8299-6210-7.
- (2020) Stream fish biodiversity and the effects of plantations in the Bintulu Region, Sarawak Anthropogenic tropical forests: human–nature interfaces on the plantation frontier, 235–274. Springer Singapore. ISBN: 978-981-13-7513-2. https://doi.org/10.1007/978-981-13-7513-2_13
- (2019) 野外における作物個体・個体群3次元再構築 新スマート農業:進化する農業情報利用, 348–349. 農林統計出版. ISBN: 978-4-89732-407-4.
- (2018) 3D visualization of calcified and non-calcified molluscan tissues using computed tomography Biomineralization, 83–93. Springer Singapore. ISBN: 978-981-13-1002-7. https://doi.org/10.1007/978-981-13-1002-7_9
- (2017) 幾何学的形態測定学とRを使った解析例 文化進化の考古学, 179–218. 勁草書房. ISBN: 978-4-326-24845-2.
発表
国際学会
口頭
- (2025) Global morphospace occupation patterns of leaf vein network structures. ACMB-JSMB2025. Kyoto, Japan. 2025/07/11
- (2024) Network feature-based phenotyping of leaf venation robustly reconstructs the latent space. IPPS2024. University of Nebraska-Lincoln, Nebraska, USA. 2024/10/10
- (2020) Quantitative Representation of Plant Style as Spacial Pattern of Foliage for Morphometrics on ill-defined Homology. Phenome2020. Tucson, AZ, USA. 2020/2/27
- (2018) Model-based morphometrics for plant phenotyping. SMB-JSMB 2018. University of Sydney, Sydney, Australia. 2018/07/09
- (2017) An image processing pipeline for acquiring 3D morphological information from "noisy" point cloud data. 2017 CIGR World Workshop in Matsuyama: OS 1 Precision measurement and modeling of dynamical plant information (Organizer: Fukuda, H.). Ehime Univ. 2017/9/3 招待
- (2017) 3D outline-based morphometrics for leaf shape with photogrammetry and image processing. The 5th International Symposium on Biological Shape Analysis. UTokyo, Tokyo, Japan. 2017/6/23
- (2016) Monitoring of soybean growth in early stage based on 3D plant analysis. 1st Asia-Pacific Plant Phenotyping Conference. 北京蟹岛度假村 三点钟会议中心, Beijing, China. 2016/10/20
- (2016) Leaf surface reconstruction from "noisy" point cloud data for geometric analysis. The 2016 (26th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology. Kyushu University, Fukuoka, Japan. 2016/9/8
- (2015) Estimation of the growth rate gradient on molluscan shells: From shape to growth. 2015 Joint Meeting of The 5th China-Japan-Korea Colloquium on Mathematical Biology and The Japanese Society for Mathematical Biology. Doshisha University, Kyoto, Japan. 2015/8/28
- (2014) The difference of morphological diversity between land and marine gastropod shells. 2014 ESA Annual Meeting. Sacramento Convention Center, CA, USA. 2014/8/14
- (2014) Quantification of coiling patterns in gastropod shells and evaluation of functional traits. Evolution2014. Raleigh Convention Center, NC, USA. 2014/6/21
ポスター
- (2022) Characterization of foliage structures using persistent homology analysis. IPPS2022. Wageningen, Nederland. 2022/9/27
- (2019) Outline-based morphometrics and geometric analysis for leaf shapes in a three- dimensional space. IPPS2019. Nanjing, China. 2019/10/24
- (2018) Model-based phenotyping of soybean canopies in early stage under a field condition with a photogrammetry studio. IPPS2018. National Wine Centre of Australia, Adelaide, Australia. 2018/10/04
- (2017) 3D Point Cloud Phenotyping of Soybean Growth in Early Stage. PAG XXV. Town & Country Hotel, San Diego, CA, USA. 2017/1/16
- (2016) 3D point cloud based monitoring of soybean growth in early stage. 4th. International Plant Phenotyping Symposium. 2016/12/13
- (2012) "Theoretical morphological approach to the diversity of gastropod shells" 1st. Joint Congress on Evolutionary Biology(Ottawa, Canada) 2012/7/7
- (2012) Morphological adaptation to fluid environments in gastropods. ESJ59/EAFES5(滋賀) 2012/3/19
国内学会
口頭
- (2026) モデルベース形態測定学とその実装. 第36回日本数理生物学会大会 企画シンポジウム S2「かたち」への数理・計算アプローチ(企画:池田 香凜,野下 浩司)くにびきメッセ(松江).2026/09/08
- (2026) 貝殻形態の理論形態空間の幾何学的性質. A12 日本古生物学会2026年年会(大阪公立大学 杉本キャンパス,大阪).2026/06/27
- (2026) イチゴ三次元形態の定量化と品種間差・等級間差の特徴づけ. B1 農業情報学会2026年度年次大会(近畿大学 東大阪キャンパス,大阪).2026/05/30
- (2025) 「かたち」を測るとわかること:形態的多様性と制約を解き明かす. 九州・沖縄昆虫研究会・日本鱗翅学会九州支部 合同大会 九州大学伊都キャンパス 2025.12.14 招待・特別
- (2025) 機械学習によるイソプレン合成酵素一次配列からの放出予測. 植物学会 シンポジウム 植物科学における異分野融合:分子・生態・情報・気候科学の融合から解き明かす植物気候フィードバック(企画:佐竹 暁子,山口 暢俊)福岡国際会議場 2025.09.20 招待
- (2025) 2D/3Dデータ解析の(周辺にありそうな)落とし穴. 育種学会 W04 データ解析の「落とし穴」 〜あなたのその解析、大丈夫ですか?〜(企画:濱崎 甲資)札幌コンベンションセンター 2025.09.10 招待
- (2025) ktch: モデルベース形態測定学向けPythonパッケージ. 農業情報学会 (京都) 2025/05/25
- (2025) 葉脈ネットワークの全球的解析. 日本生態学会第72回全国大会. (北海道)2025/03/17
- (2024) 「かたち」のフェノーム解析. 応用数理学会 正会員OS「かたちの数理とその応用」 2024.09.16 招待
- (2024) 遊走細胞表現型スクリーニングへの形態測定学によるアプローチ. 数理生物学会(ホスト:北海道大学). 2024/9/13
- (2024) ktch: モデルベース形態測定学向けPythonパッケージ. 生態学会(ハイブリッド,ホスト:横浜国立大学). 2024/3/16
- (2023) ktch: モデルベース形態測定学向けPythonパッケージ. 数理生物学会(ホスト:奈良女子大学). 2023/9/6
- (2022) さまざまな形態記述子によるモデルベース植物フェノタイピング. 日本植物バイオテクノロジー学会 シンポジウム「植物フェノタイピングに向けたデジタルテクノロジー」(企画:稲田 のりこ,内海 ゆづ子) 大阪公立大学 2022.09.13 招待
- (2022) 細胞形状と動きの形態測定学的解析. 数理生物学会(オンライン,ホスト:明治大学).2022/9/7
- (2021) 草姿・草型のフェノタイピング:3次元計測と「かたち」の数理モデル化. 植物科学を変える先端分析技術と大規模データ統合解析.日本植物学会 第85回大会(オンライン).2021/09/18 招待
- (2021) 輪郭形状解析におけるレジストレーション:軸と対称不整合についての比較. 数理生物学会(オンライン,ホスト:宮崎大学).2021/09/13
- (2021) 草姿・草型の数理モデル化と高効率フェノタイピングへの応用. OS-B JSTさきがけプロジェクト「情報協働栽培」から.農業情報学会2021年度 年次大会(オンライン).2021/05/23 招待
- (2021) 3次元空間における植物葉面再構築と輪郭形状解析. 日本生態学会第68回全国大会(オンライン,ホスト:岡山).2021/03/17
- (2021) kaigara:貝殻理論形態学Pythonパッケージ. 古生物学会(オンライン,ホスト:横浜国立大学).2021/02/06
- (2020) “異常巻き”を含む貝殻巻きパタンの定量的解析・モデル化. 2020年度日本数理生物学会年会(オンライン,ホスト:名古屋大学).2020/9/21
- (2019) 植物形態の計測とモデル化. 2019年度日本数理生物学会年会 シンポジウム「農学における数理生物学」(企画:野下 浩司)東京工業大学. 2019/9/16
- (2019) 野外における植物3次元再構築と定量的解析. 日本植物フェノタイピングネットワーク キックオフシンポジウム@日本育種学会第135回講演会グループ研究集会.2019/01/24
- (2018) 野外における植物3次元形態の再構築と計測. 電気学会 電子・情報・システム部門大会 MC2「農学・植物科学研究における計測技術」(企画:七夕 高也) 北海道大学.2018/09/05 招待
- (2018) 貝殻巻きパタンの定量化:”異常巻き”への拡張.M01-09. 日本生態学会第66回全国大会 (神戸国際会議場).2018/03/16
- (2018) 形態測定学の異分野融合:伝統的,幾何学的,…?. 日本生態学会第 65回 全国大会 自由集会W03「道具としての形態測定学:形の解析から見る過去と未来」(企画:高橋 一男,立田 晴記) 札幌 2018/03/14 招待
- (2017) 郭 威, 加賀 秋人, 岩田 洋佳. 3次元点群データを利用した作物群落のモニタリング.O-60. 日本数理生物学会第27回大会(北海道大学,北海道).2017/10/8
- (2017) 骨構造の定量化へ向けたステレオロジ的解析. 日本応用数理学会 2017年度 年会 正会員主催 OS「計量(デジタル)病理学のフロンティア」(企画:寺本 敬,岩見 真吾)武蔵野大学 2017/9/8 招待
- (2016) 点群データによるダイズ初期生育のモニタリング. 515 育種学会 第130回講演会(鳥取大学,鳥取) 2016年9月25日.優秀発表賞
- (2016) 腹足類殻形態の形態空間における発生的制約. 日本進化学会第18回大会 O-1A-4 東京工業大学 2016/8/25
- (2016) 腹足類殻形態の理論形態空間の対応関係とその変換. 日本古生物学会2016年年会(福井県立大学,福井). 2016/6/25
- (2016) 形態測定学が解決する課題と生物地理学への応用の可能性. 日本生物地理学会 2016年度大会シンポジウム「形態測定学と地理的分布:かたちの定量化と生物地理学・文化地理学への応用」(企画:三中 信宏) 東京大学 2016/4/17 招待
- (2015) 植物器官の効率的フェノタイピング:画像解析と形態測定学. 日本育種学会第128回講演会(平成27年度秋季大会)ワークショップ「W05: 育種学と農学のこれからを考える30 〜フェノタイピングは頭痛の種?〜」(企画:矢部 志央理,上原 奏子,吉津 祐貴) 新潟大学 2015/9/11 招待
- (2015) 形態測定学の進化生物学における活用:細胞から個体,人工物まで. 日本進化学会第17回大会ワークショップ「W-03: 日本の考古遺物を中心とした文化進化的考察」(企画:田村 光平,中尾 央,三中 信宏) 中央大学 2015/8/20 招待
- (2015) 貝殻形態からその成長様式へ:成長管モデルとGrowth Vector Map. 日本古生物学会第164回例会(豊橋市自然史博物館,愛知). 2015/1/31
- (2014) 腹足類殻の巻きパタン定量化から防御形質評価まで. 日本生態学会第61回全国大会 W16-1 広島国際会議場 2014/3/14
- (2014) 腹足類殻の巻きパタンの定量化:成長管モデルパラメータ一定の場合. 日本古生物学会2014年年会 B04. 2014/1/25
- (2013) 生物のかたちのモデリングと定量化:3D イメージデータが拓く個体発生解析の可能性と 2D イメージデータの有効活用. 第 45回種生物シンポジウム(企画:入谷 亮介) 別府市ふれあい広場サザンクロス 2013/11/30 招待
- (2013) 腹足類殻の"巻き"パタンの定量化. 日本数理生物学会第 23 回大会 S1-1 静岡大学 2013/9/11. (シンポジウム)
- (2013) 腹足類殻の"巻き"パタンの3Dおよび2Dイメージデータに基づく定量化法. 日本古生物学会2013年年会(熊本) 2013/6/29
- (2013) 腹足類の殻形態と物理的制約への理論形態学的アプローチ. 日本生態学会第60回全国大会(自由集会,静岡) 2013/3/5
- (2012) 腹足類穀形態の物理的環境への適応. 日本数理生物学会第22回大会(自由集会,岡山) 2012/9/11
- (2011) ホヤ脊索における収斂伸長. 日本数理生物学会第21回大会(明治大学,東京). 2011/9/15
- (2011) 腹足類の殻口の傾きと生息環境. 日本古生物学会2011年年会(金沢大学,石川) 2011/7/2
- (2011) 腹足類に殻口の傾きにおける制約. 日本生態学会第58回大会(札幌コンベンションセンター,北海道) 2011/3/10
- (2010) 腹足類の殻形態における制約. 日本数理生物学会第20回大会(北海道大学,北海道) 2010/9
- (2010) 腹足類の形態的多様性の制約. 日本古生物学会2010年年会(筑波大学,茨城) 2010/6/13
ポスター
- (2025) ktch: モデルベース形態測定学向けPythonパッケージ. 定量生物学の会 福井キャラバン 2025(福井大学,福井).2025/11/22
- (2025) 「かたち」のフェノーム解析. P47 定量生物学の会 九州キャラバン 2025(九州大学 馬出病院キャンパス,福岡).2025/1/11
- (2019) 植物フェノタイピング向け仮想データセットの生成と解析. 定量生物学の会 北海道キャラバン 2019(北海道大学,北海道).2019/11/06
- (2017) 郭 威, 加賀 秋人, 岩田 洋佳. 3D点群データに基づく植物形態の経時的モニタリング. P2-O-435. 日本生態学会第63回全国大会(早稲田大学,東京) 2017/3/22
- (2017) 3D点群データを利用した植物群落のモニタリング.P-82. 定量生物学の会 第八回年会(自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター,愛知) 2017/1/8
- (2016) 葉形状の3D表面データからの再構築と幾何学的解析. 日本生態学会第63回全国大会(仙台国際センター,宮城) 2016/3/22
- (2015) 腹足類の殻に保存された成長の記録. 日本生態学会第62回全国大会(鹿児島大学,鹿児島) 2015/3/19
- (2014) 腹足類殻形態の定量化と機能評価. 日本生態学会第 61 回全国大会 PA2-013 広島国際会議場 2014/3/16
- (2013) 腹足類殻形態の定量化フレームワーク構築に向けて. 日本生態学会第60回全国大会(静岡) 2013/3/6
- (2012) 腹足類の殻口の傾き. 第161回日本古生物学会例会(富岡市生涯学習センター,群馬) 2012/1/21. ポスター賞
- (2010) 腹足類における機能的トレードオフ. 第12回日本進化学会大会(東京工業大学,東京) 2010/8/5
研究集会・セミナー
- (2026) Two- and three-dimensional phenotyping. P-23 数理薬理シンポジウム 2026(第2回,北里大学 白金キャンパス,東京).2026/07/31
- (2026) 幾何学的形態測定学の基礎とktchによる実践. 「かたち」の定量ワークショップ 2026(企画:野下 浩司,堤 真人,鈴木 誉保)九州大学 医学部百年講堂(福岡).2026/07/28
- (2026) 「かたち」を測る・モデル化する:形態的多様性への定量的アプローチ. 微化石リファレンスセンター(MRC)研究発表会 JAMSTEC 横浜研究所 2026.3.17 招待・特別
- (2026) 3次元定量解析による栽培植物研究の可能性. 研究ネットワーク構築ワークショップ「作物遺伝資源×考古学で拓く農と食の共創進化史」(企画:岡山大学) 岡山国際交流センター 2026.03.05 招待
- (2026) 表現型潜在空間を特定するための定量的アプローチ. 九州大学IMI 共同利用 シンポジウム「潜在的な動態を理解する数理」 九州大学 2026.02.17 招待
- (2026) 三次元形態フェノタイピング. 第10回理論免疫学ワークショップ(企画:岩波 翔也,新潟) 2026.01.21
- (2025) 「かたち」の定量解析による学際研究. 新知創造学際ハブ第6回研究会「かたちを科学する:デジタルがつなぐ考古学・自然史・材料科学」(企画:福井県立大学 恐竜学部) 福井県立大学 2025.10.15 招待
- (2025) 「かたち」の数理解析とツール開発. 第9回理論免疫学ワークショップ(企画:岩波 翔也,高知).2025.02.04
- (2023) Three-dimensional leaf edge reconstruction using a combination of two- and three-dimensional phenotyping approaches. Summit on the Frontiers of Plant Phenomics. Nanjing Agricultural University. 2023.12.09 招待
- (2023) Plant phenotyping methods using image analysis, machine learning, mathematics, and morphometrics. ICIAM WIS2023 Kyushu University. 2023.09.15 招待
- (2023) 細胞表現型スクリーニングへ向けた形態記述子による定量化. 第7回理論免疫学ワークショップ(企画:岩波 翔也,鹿児島).2023.03.19
- (2022) 形態的多様性と制約. ソフトバイオ研究会2022(企画:石本 志高,津川 暁,村島 隆浩) 秋田 2022/11/16 招待・特別
- (2022) Phenotyping studies using morphometric descriptors for multi-omics analysis. 1st International Symposium on Aihara Moonshot Project. 2022.06.06
- (2021) 「かたち」のモデル化・定量化のための幾何学. ワークショップ「生命医科学における数理科学の最前線:データサイエンスから代数・幾何・記号学まで - さらなる展開を目指して」 2021/10/02 招待
- (2021) Morphometrics and its applications. RIMS Workshop Mathematical methods for the studies of flow, shape, and dynamics. Organizers: Masanobu Inubushi (Tokyo U. of Sci.), Kenta Ishimoto (Kyoto U.). 2021/08/31 招待
- (2021) 植物の「かたち」を測る・モデル化する:数理モデルの構築・定量化の理論提案・植物フェノタイピング技術の開発. 超分野植物科学研究会(TDPS) 第1回研究会(オンライン).2021/6/4
- (2021) 骨構造の積極的定量化とデータ解析. 第5回理論免疫学ワークショップ(企画:岩波 翔也,オンライン).2021/02/12
- (2020) 葉群の空間パターンとしての草姿・草型の定量的表現:相同性が自明でない場合の形態測定学に向けて. 第16回 生物数学の理論とその応用 ~生命現象の定量的理解に向けて~.京都大学 数理解析研究所.2020/1/28
- (2020) 3次元輪郭形状解析と考古資料への応用. シンポジウム『人工(遺)物の三次元計測と幾何学的形態測定の理論と実践』.2020/01/25
- (2019) 植物3次元形態データセットの作成と全体構造を記述する特徴量の開発. 数理・データサイエンスに関する教育・研究支援プログラム 研究成果発表会・交流会.九州大学 数理・データサイエンス教育研究センター.2019/12/13
- (2019) 軟体動物殻形態の理論モデルによる「かたち」と「かたち作り」の定量化. 第14回バイオミネラリゼーションワークショップ 東京大学大気海洋研究所.2019/11/09 招待
- (2019) 植物フェノタイピング技術の開発と活用. 2019年度 九州大学オープンイノベーションワークショップ.2019/11/08
- (2019) 3D high through-put phenotyping for Smart agriculture. International Smart Agriculture Symposium (Organizer: Wei Guo). UTokyo. 2019/09/25
- (2019) 植物の「かたち」を測る・モデル化する:数理モデルの構築・定量化の理論提案・植物フェノタイピング技術の開発. 九州大学大学院農学研究院 伊都キャンパス農場フォーラム.2019.08.08
- (2019) 植物3次元形態の取得から定量化へ:写真測量技術と点群解析. JST/CREST Phenomics講習会「はじめてみよう・植物デジタル形質評価」.ホテルマリックス 宮崎.2019/01/31
- (2019) 骨構造の積極的定量化へ向けた数理シミュレーションと画像解析. 第3回 理論免疫学ワークショップ(企画:岩波 翔也)(秋田市にぎわい交流館).2019/01/24
- (2018) 3D field phenotyping of canopy development in soybean. PBIO Seminar (Host: Alexander Bucksch), UGA. 2018/11/12 招待
- (2018) 生物を通して読み解く形態と機能の関係性. 第115回ロボット工学セミナー「構成技術の変革から考える5年,10年後先のロボティクスの未来」(企画:梅舘 拓也)東京大学 武田ホール.2018/07/19 招待
- (2018) かたちを測る:形態測定学と応用としての植物フェノタイピング. MACSセミナー SG2「イメージングと数理の融合:動きや形の定量とモデリング」(企画:平島 剛志)2018/02/27 招待
- (2018) かたちの数理生物学:巻貝殻形態とその後. 巌佐庸教授 退官記念シンポジウム(稲盛財団記念館(稲盛ホール),九州大学).2018/02/22
- (2018) 骨構造のステレオロジ的解析とシミュレーション. 第2回 理論免疫学ワークショップ(企画:岩波 翔也)(富山県民共生センターサンフォルテ).2018/02/02
- (2017) 植物のかたちを測ろう. 農学中手の会 第3回研究集会(雄琴温泉 湯の宿 木もれび,滋賀).2017/12/3
- (2017) 郭 威, 加賀 秋人, 岩田 洋佳. 作物形態の3D点群モニタリング.J16. 農業×情報通信ワークショップ2017(鶴岡メタボロームキャンパス,山形).2017/11/16
- (2017) Monitoring of soybean growth in early stage based on 3D plant analysis. Plant Phenotyping Symposium (Organizer: Ding, Y.) Nanjing Agricultural University, Nanjin, China. 2017/10/23 招待
- (2017) 3D point cloud based monitoring of soybean canopies. High-Throughput Biology to Accelerate Crop Improvement (Organizer: Yano, K.) UTokyo. 2017/6/19 招待
- (2017) 点群解析と表面モデリングを利用した植物フェノタイピングへの取り組み. 精密工学会 大規模環境の3次元計測と認識・モデル化技術専門委員会 第27回定例研究会(企画:増田 宏)東京大学 2017/6/12 招待
- (2017) 生物のかたちのモデル化と定量化. さきがけ情報協働栽培 研究領域公開ワークショップ「栽培モデル研究の最前線」(企画:JST)東京大学 2017/2/10 招待
- (2016) 植物3次元形態のフェノタイピングへの取り組み. 農学中手の会 第2回研究集会(雄琴温泉 湯の宿 木もれび,滋賀)2016年11月11日
- (2016) Monitoring of soybean growth in early stage based on point cloud data. JSMB 2016 satellite workshop: Mathematical modeling on Ecology & Evolution (Organizers: Tachiki Y. and Iritani R.) Kyushu Univ. 2016/9/11 招待
- (2016) Leaf surface reconstruction from noisy point cloud. Multi-scale Plant Phenomics. The University of Tokyo, Japan. Sep. 3, 2016
- (2016) 腹足類の殻形態とその形成プロセスの定量化. 底生生物学分野セミナー(企画:福森 啓晶) 東京大学 2016/5/13 招待
- (2016) 定量的形態測定入門. 数理科学的手法を駆使した生命現象の定量化への挑戦.宇奈月国際会館.2016/3/28 招待
- (2016) Leaf surface reconstruction from point cloud data: a post-process of field phenotyping. Field Phenomics with Big Data. The University of Tokyo, Japan. 2016/2/10
- (2015) 「かたち」と「かたち作り」を測る:形態測定学・理論形態学の活用. 進化古生物学セミナー(企画:遠藤一佳) 東京大学 2015/12/15 招待
- (2015) CTデータを利用した腹足類殻形態の定量化. 動物生態学研究室ゲストセミナー(企画:細 将貴) 京都大学 2015/2/2 招待
- (2014) University of Pennsylvania Plotkin Lab. Seminar 2014 年 4 月
- (2014) 腹足類殻形態の定量化と機能評価:測定手法の開発と形態の生態学的意義を探る. 東京大学 農学部 生産・環境専攻セミナー(企画:岩田 洋佳) 2014/3/11 招待
- (2013) Geometric Analysis and Quantification of Coiling-Patterns of Gastropod Shells based on 3D and 2D Image Data. 九州大学 数理生物学研究室 MEセミナー 2013年4月23日
- (2012) Theoretical morphological study on gastropod shell forms. 明治大学 GCOE MEE Seminar(企画:岡嶌 亮子)2012年1月 招待
- (2011) The difference of aperture inclination between land and marine snails. 九州大学 数理生物学研究室 MEセミナー 2011年2月22日
- (2010) Convergent extension of ascidian notochord. 九州大学 数理生物学研究室 MEセミナー 2010年12月20日
- (2010) Constraint of morphological variation in gastropod snails. 九州大学 数理生物学研究室 MEセミナー 2010年5月11日
企画
- (2026) 「かたち」への数理・計算アプローチ. 企画シンポジウム S2 第36回日本数理生物学会大会(くにびきメッセ,松江).2026/09/08
- (2026) 「かたち」の定量ワークショップ 2026. 九州大学 医学部百年講堂(馬出キャンパス,福岡).2026/07/27–28
- (2026) やってみよう!「かたち」の定量解析:理論形態モデル. 小集会3(ランチョン) 日本古生物学会2026年年会(大阪公立大学 杉本キャンパス,大阪).2026/06/28
- (2026) やってみよう!「かたち」の定量解析. W08 日本生態学会第73回全国大会(京都大学,京都).2026/03/12
- (2025) やってみよう!「かたち」の定量解析. ランチョン小集会 日本古生物学会第175回例会(薩摩川内市SSプラザせんだい,鹿児島).2025/12/06
- (2025) 「かたち」のフェノタイピングによる形態的多様性と制約の解明. W26 日本生態学会第72回全国大会 札幌コンベンションセンター. 2025/03/18
- (2022) 1st International Symposium on Aihara Moonshot Project. Zoom Webinar. 2022/06/06-08
- (2022) 植物フェノタイピングは何を明らかにするか. S27 日本生態学会第69回全国大会.2022/03/19
- (2019) 農学における数理生物学. 2019年度日本数理生物学会年会 東京工業大学 2019/09/16
- (2018) かたち作りの数理とその構築・検証:数理モデルの出番はいつ?. 第15回 生物数学の理論とその応用 −次世代の数理科学への展開−.京都大学数理解析研究所.2018/09/13
- (2017) The Fifth International Symposium of Biological Shape Analysis (ISBSA). UTokyo, June, 2017
- (2016) Plant phenotyping with morphometrics. JSMB2016 8E1-S11 Kyushu Univ. 2016/9/8
- (2016) Multi-scale Plant Phenomics. UTokyo 2016/9/3
- (2016) 数理科学的手法を駆使した骨粗鬆症の早期診断と予後予測への挑戦. 数学協働プログラム スタディグループ ひめぎんホール 2016/8/16-18
- (2016) 3D形態測定学. 夜間小集会 2016年日本古生物学会年会 福井県立大学 2016年6月22日
- (2016) 貝類を通して生命現象に迫る 4: 生活史. 日本生態学会第63回全国大会 W15 仙台国際センター 2016年3月
- (2016) Field Phenomics with Big Data. Feb. 10, 2016
- (2015) 貝類を通して生命現象に迫る 3: 行動. 日本生態学会第 62 回全国大会 W27 鹿児島大学 2015年3月
- (2014) 貝類を通して生命現象に迫る 2: 生物間相互作用. 日本生態学会第 61 回全国大会 W16 広島国際会議場 2014 年3月
- (2013) 生物のかたちを測る:変形・成長.多様性を定量化するために. 日本数理生物学会第23回大会 S1 静岡大学 2013年9月
- (2013) 貝類を通して生命現象に迫る:進化・生態・発生. 日本生態学会第60回全国大会 2013年3月5日
- (2012) 生物のかたちを理解するための数理的手法:発生から適応まで. 第22回日本数理生物学会大会 2012年9月11日
講師
- スマート農業指導者養成研修.
愛知県農業試験場
- 2023 年度:時系列データ解析(1),時系列データ解析(2),時系列データ解析(3)
- 2022 年度:時系列データ解析(2),時系列データ解析(3)
アウトリーチ
- サイエンスメンタープログラム. 日本科学協会 2023-03–現在 メンター
- . 大解析!!ゴーヤ怪獣のすべて. ズカンフ〜ザッシ『文化と生物学』 1 2.6, pp. 1-10 2023 取材協力
- 「貝の不思議」展. 文京区教育センター 2階 大学連携事業室 2021-05-15–2021-10-02 協力
- 特別展示『ボトルビルダーズ――古代アンデス、壺中のラビリンス』. 東京大学総合研究博物館小石川分館/建築ミュージアム (SfM による3Dモデル作成) 2020-09-24–2020-11-29 展示協力
- (2018) 貝殻形態の多様性を数理モデルで解明する. 第33回metaPhorest セミナー AKI INOMATAx野下浩司 貝のカタチ.2018/5/26 講演
- (2017) ダイズ群落の3D計測への取り組み. CREST「農業ビッグデータ」公開セミナー 基礎研究で未来の『食と農業』を切り拓く(十勝さらべつ熱中小学校,北海道) 2017年8月18日 講演
最終更新日